Retrovirus

[mala]

Killen som börjat att ta Raltegravir börjar känna sig bättre: http://www.forums.aboutmecfs.org/showthread.php?5250-Starting-Raltegravir
Det ser ju lovande ut. Det kan förstås också bero på att kaliumet i raltegravir gör en piggare utan att direkt bota en.

[mala]

Denna tråd handlar om en tjej som tar en kombinationsbehandling av olika AIDS-mediciner hon har på bara en månad förbättrats mycket. Det här börjar se lovande ut.

http://www.forums.aboutmecfs.org/showthread.php?5270-Antiretrovial-Trial/page16

[mala]

Jag mailade runt dessa källor till våra största tidningar. Om ni vill: klipp ur och maila er lokaltidning.
Denna gång två statliga regeringsorgan i USA som står bakom studien.

Länkar:
Medicinska tidsskrifter
http://www.pnas.org/content/early/2010/08/16/1006901107.full.pdf+html
http://www.pnas.org/content/early/2010/08/16/1007944107.full.pdf#page=1&view=FitH
http://www.pnas.org/content/early/2010/08/16/1012027107.full.pdf+html
http://news.sciencemag.org/sciencenow/2010/08/second-paper-supports-viral-link.html

NIH Teleconference
http://www.nih.gov/news/health/aug2010/cc-23.htm
http://www.mediafire.com/?6phy8fyxxj4mhy9
http://www.mediafire.com/?40esxfnjflnyzhz

NIH, FDA CDC information pages
http://www.fda.gov/BiologicsBloodVaccines/SafetyAvailability/ucm223232.htm
http://www.cdc.gov/xmrv/questions-answers.html

Mainstream media
WSJ http://online.wsj.com/article/SB10001424052748703846604575447744076968322.html
Washington post http://voices.washingtonpost.com/checkup/2010/08/new_evidence_virus_may_cause_c.html
Washington post http://www.washingtonpost.com/wp-dyn/content/article/2010/08/23/AR2010082303864.html
Washington post http://www.washingtonpost.com/wp-dyn/content/article/2010/08/23/AR2010082304486.html
NY Times http://www.nytimes.com/2010/08/24/health/research/24fatigue.html
Bloombergs http://www.businessweek.com/news/2010-08-23/chronic-fatigue-linked-to-mouse-virus-in-u-s-government-study.html
US News and world report http://health.usnews.com/health-news/family-health/pain/articles/2010/08/23/more-evidence-mouse-virus-plays-role-in-chronic-fatigue-syndrome.html
Reuters http://www.reuters.com/article/healthNews/idUSTRE67M55S20100823
NPR http://www.npr.org/blogs/health/2010/08/23/129383111/scientists-find-traces-of-virus-in-chronic-fatigue-patients
CNN http://www.cnn.com/2010/HEALTH/08/23/chronic.fatigue.virus/
Gawker http://io9.com/5620032/further-proof-that-chronic-fatigue-syndrome-is-linked-to-viruses
LA Times http://www.latimes.com/health/la-sci-fatigue-virus-20100824,0,127566.story

Speciality sites Health
http://chronicfatigue.about.com/b/2010/08/23/nihfda-study-confirms-xmrv-tied-to-chronic-fatigue-syndrome.htm
http://www.prohealth.com/library/showarticle.cfm?libid=15553
http://www.psychologytoday.com/blog/overcoming-pain/201008/mlv-joins-xmrv-the-latest-unproven-cause-chronic-fatigue-syndrome
http://www.the-scientist.com/blog/display/57628/
http://www.scientificamerican.com/blog/post.cfm?id=new-research-linking-chronic-fatigu-2010-08-23

WPI Resonses
http://www.youtube.com/watch?v=ne7if7FKJFg
http://www.youtube.com/watch?v=9ZEwQUg7o6I

[affa]

Oj oj oj Mala detta var inte lite information heller!! 

[Mayordomo]

Den nya studien där retrovirus hittas hos ME-patienter är intressant. Det verkar dock som att de inte hittat exakt XMRV utan MLV istället. Jag har inte än haft ork att sätta mig in i skillnaden. De båda virusen har samma gag-sekvenser på DNAt har jag uppfattat det som. Om någon får någon koll på det här berätta gärna om det.


Detection of MLV-related virus gene sequences in blood of patients with chronic fatigue syndrome and healthy blood donors
Shyh-Ching Loa, Natalia Pripuzova, Bingjie Li, Anthony L. Komaroff, Guo-Chiuan Hung, Richard Wang, and Harvey J. Alter
May 25, 2010
http://www.pnas.org/content/early/2010/08/16/1006901107.full.pdf+html

First press statement on Alter et al paper:
http://www.prnewswire.com/news-releases/study-presence-of-murine-leukemia-virus-related-gene-sequences-found-in-cfs-patients-101316939.html

Four Viruses? The Alter XMRV Paper Arrives
Phoenix Rising, Cort Johnson, 2010-08-24
http://www.forums.aboutmecfs.org/content.php?213-Four-Viruses-The-Alter-XMRV-Paper-Arrives

Articles in papers and magazines after the Alter/LO FDA/NIH study about XMRV and MLV`s in ME/CFS patients
http://esme-eu.com/news/articles-in-papers-and-magazines-after-the-alter-lo-fda-nih-study-about-xmrv-and-mlv-s-in-me-cfs-patients-article393-7.html

[Mayordomo]

Det verkar som om Judy Mikovits förklarar att XMRV och MLV är av samma familj av gammaretrovirus i denna video. Jag tror XMRV är en mer specifik typ av MLV, dvs XMRV skulle vara en variant av MLV. Virus->retrovirus->gammaretrovirus->MLV->XMRV. Är det så ni uppfattar det?

CFIDS Association verkar ha en beskrivning av Lo/Alter studien. Jag hittade där en populärvetenskaplig beskrivning av de olika stammarna med hjälp av bilder på apelsinfrukter.

Judy Mikovits reaction to the Lo/Alter paper
http://www.youtube.com/watch?v=9ZEwQUg7o6I

STUDY PUBLISHED IN PNAS LINKS CFS TO MURINE LEUKEMIA VIRUSES
CFIDS Association of America, August 27, 2010
http://cfids.org/mlv/

A Pictorial Essay to Describe XMRV, MLVs and Gammaretroviruses
http://cfids.org/mlv/pictorial-essay.pdf

[Fia]

Ja Kasper, jag uppfattar det som du, att XMRV är en genetisk variant av MLV-liknande virus och tillhör gammaretrovirus. XMRV är dock nyupptäckt (från 2006) till skillnad från MLV som har varit känt bland forskare i många år.

[Mayordomo]

Jag har läst lite mer...

Lo/Alter har gjort phylogenetiska träd. Det handlar om att jämföra gag-gensekvenser (specifika DNA sekvenser) mellan virusstammar för att se vilka som ligger närmast varandra "släktmässigt". Lo/Alter fick fram att CFS patienterna hade tre olika stammar av virus (MLV-CFS-typ1,typ2,typ3). De flesta hade stam typ 1 (MLV-CFS-typ1). Hos en frisk person (blod donator) fann de ytterligare en stam av MLV. Det vill säga att de hittade totalt 4 stammar av MLV gammaretrovirus.

Lo/Alter fick fram i sina phylogenetiska träd att de stammar av virus de identifierade med PCR inte hamnar i gruppen XRMV. Alla deras fyra varianter har mer släktskap med polytropiska mus endogena retrovirus (polytropic mouse endogeneous retroviruses) än med XMRV. Polytropiska mus virus infekterar fler djur än möss. Xenotroiska mus virus infekterar ej lägre möss eftersom mössen tillbakabildat receptorer för dessa virus.

Lo/Alter konfiermerade därmed den ursprunliga Lombardistudien av WPI på så sätt att de hittade MLV gammaretrovirus. Lo/Alter hittade däremot inte samma stam av MLV gammaretrovirussom Lombardi. Dock verkar de båda forskargrupperna överens om att det hela verkar stämma. WPI hade funnit en väldigt liten genetisk varians hos sina virus, men det är motsägelsefullt när det gäller retrovirus som är kända för att ha en stor genetisk variation (de muterar ofta). Lo/Alter verkade ha en förklaring till de olika resultaten. De talar om PCR primers som varit för specifika.

Fortfarande ligger Lombardi och Silverman "steget före" på så sätt att de har detekterat virala antigener, antivirala antikroppar och retrovirala partiklar med elektromikroskåp. De har odlat viruset och överfört infektionen på makaker.


Ordlista:
retrovirus = en stor grupp RNA-virus som omvandlar virusets RNA till DNA som sedan införs i värdcellens DNA. HIV och HTLV är exempel på retrovirus. De flesta retrovirus är tumörframkallande.
gamma retrovirus = en undergrupp till retrovirus
ERV = endogenous retrovirus
fylogenetisk = som berör släktets utveckling
MLV = murine leukemia virus, en typ av gammaretrovirus
XMRV = xenotropiskt murine lekukemia related virus
PCR = polymerase chain reaction, en specifik metod i molekylärbiologi för att mångfaldiga en enskild eller några få kopior av en DNA sekvens.
PCR primer = en sträng av nukleidsyra som används som startpunkt för DNA-syntes.
endogent retrovirus = retrovirus som ligger inbyggda i genomet hos värddjuret från tidigare infektion i släktets historia. Det är en sorts fossil som ligger i DNA:t hos t.ex. människor. Cirka 20% (?) av människans DNA beräknas utgöras av retrovirus.
ecotropiskt virus = virus som bara kan infektera ett smalt spektrum av värddjur.
polytropiskt virus = virus som kan infektera flera värddjur.
xenotropiskt virus = virus som ej längre kan infektera sitt ursprungliga värddjur, men därmed inte sagt att det inte kan infektera andra värddjur.
murin = råttdjur, musdjur
gag-sekvens = sekvens i virus DNA som kodar proteiner för uppbyggnad av vissa delar av viruset.
DNA = deoxyribonukleidsyra, en sträng av nukleotider/baspar som kodar hur proteiner skall tillverkas i cellerna. DNA:t ligger i cellernas kärna. Nukleotiderna kan vara adenine (A), guanine (G), cytocine (C) eller uracil (U), och bildar därmed ett kvartärt(=med bas 4) nummer/kod-system.

Bild av gammaretrovirus där det framgår vad gag-sekvensen sitter på DNAt och vad den används till för att bygga upp viruspartikeln med protein.
http://expasy.org/viralzone/all_by_species/67.html

Phylogenetiskt träd (släktträd) av retrovirus typer:
http://images-mediawiki-sites.thefullwiki.org/11/2/4/5/82691072448968544.jpg

Referenser

Lombardi VC et al. Detection of an infectious retrovirus, XMRV, ... 2009

Silverman RH et al. The human retrovirus XMRV in prostate cancer and chronic fatigue syndrome. 2010

Detection of MLV-related virus gene sequences in blood of patients with chronic fatigue syndrome and healthy blood donors
Shyh-Ching Loa, Natalia Pripuzova, Bingjie Li, Anthony L. Komaroff, Guo-Chiuan Hung, Richard Wang, and Harvey J. Alter
May 25, 2010
http://www.pnas.org/content/early/2010/08/16/1006901107.full.pdf+html

[mala]

Flera av de som börjat med olika kombinationsterapier med antieretrovirala medel innan MLV gjorde sitt intåg, går det ff inte så bra för, Raltegravirkillen, jimbob, har tvingats sluta med sin kur, daffodil mår pyton. Dock håller det i sig för den läkare som har denna blogg http://treatingxmrv.blogspot.com/2010/08/reentry-phenomena.html. Hon och hennes dotter går från klarhet till klarhet. Det är skön läsning. Jag har mailat Ila Singh som gjort flera in vitrostudier av befintliga ARV:s mot XMRV och frågat om nya är på gång för MLV:s. Ännu ej svar. Mot slutet av hösten kan vi kanske veta lite mer om MLV och hur de responderar på ARV.

[Mayordomo]

Kanske eventuellt oxymatrin (Equilibrant) kan fungera emot retrovirus? Oxymatrin skall ju öka Th1 övermakten i Th1/Th2 balansen och därmed öka det intracellulära immunförsvaret. Har för mig att någon funderat i banorna att så många blivit bättre av oxymatrin i behandling emot enterovirus i själva verket även tagit retrovirus. Bara en fundering...

[mala]

Den där artikeln har Kasper bemött tidigare: http://www.lakartidningen.se/includes/07showComments.php?articleId=14178#3849

[Mayordomo]

Mästaren på virusjakt Dr Ian Lipkin skall börja jaga XMRV hos ME-drabbade.


A Man From Whom Viruses Can't Hide
The New York Times. November 22, 2010
http://www.nytimes.com/2010/11/23/science/23prof.html?_r=2&scp=1&sq=lipkin%20xmrv&st=cse

"We get 10,000 samples a year easily," Dr. Lipkin said. "We've discovered at least 400 new viruses since I came to Columbia in 2002, and the process is accelerating."

Over the past 20 years, Dr. Lipkin has built a reputation as a master virus hunter. He has developed ways to quickly identify familiar viruses and ways to search for new ones.

"If scientists are lucky, they'll identify one novel virus in their whole life," said Dr. Anthony S. Fauci, director of the National Institute of Allergy and Infectious Diseases. "Lipkin really stands out from the crowd."

http://www.nytimes.com/2010/11/23/science/23prof.html?_r=3&pagewanted=2&sq=lipkin%20xmrv&st=cse&scp=1

Dr. Lipkin is now preparing to dive into a new controversy. In October 2009, a team of scientists claimed to find a virus known as XMRV in people with chronic fatigue syndrome. A pitched debate has arisen over the findings. A number of other groups have since failed to find the same link. To make matters more confusing, a team of researchers from the Food and Drug Administration, the National Institutes of Health and Harvard Medical School reported in August that they found related viruses in people with chronic fatigue, but not XMRV itself. "I think we have to keep an open mind on this," Dr. Lipkin said.

In September, Dr. Fauci asked Dr. Lipkin to organize a large-scale investigation. Earlier this month, Dr. Lipkin brought together scientists from three labs that have gotten contradictory results to begin working together on a new search for the link.

"There isn't anybody any better at this than Ian Lipkin," said Dr. Fauci. "If he can't find it, it probably doesn't exist."

[Mayordomo]

Uppsalaforskaren Jonas Blomberg berättade om vetenskapliga fynd kring MLV och XMRV virus på Läkarstämman i Göteborg.

Nytt virus misstänks orsaka sjuklig trötthet
Expressen, 02 dec 2010.
http://www.expressen.se/halsa/1.2237675/nytt-virus-misstanks-orsaka-sjuklig-trotthet

Forskare vill testa hiv-medicin mot trötthetssyndrom
Dagens Medicin. 2010-12-02
http://www.dagensmedicin.se/nyheter/2010/12/02/virus-misstanks-orsaka-sju/index.xml

"Vaccinera dig - mot trötthet"
Aftonbladet, nätupplagan, 2 december 2010
http://www.aftonbladet.se/kropphalsa/somnklubb/article8215549.ab

[Mayordomo]

Jag har fått en länk till Läkarstämman. Kanske det går att hitta mer info där nu eller senare.

Svenska Läkaresällskapet, Medicinska Riksstämman, Göteborg 2010
http://nemonet.swefair.se/templates/FlexiblePage____175098.aspx

[affa]

Hittar inte in på området som handlar om XRMV kontra ME/CFS  

Trots att jag kom in på Läkarstämmans Hemsida via länken, men gick igenom de olika föreläsarna och ämnena, utan att finna rätt föreläsning.?

[Mayordomo]

Jag hittar inte något heller på Läkarstämmans hemsida. Kanske de inte lagt in allt material ännu?

[Mayordomo]

Fler artiklar om XMRV som följd av Läkarstämman i Göteborg 2010 då Jonas blomberg, professor i klinisk virologi, talade om XMRV och ME.


Gåtan kring trötthet kan vara löst
Rapport. 2 dec 2010
http://svt.se/2.22620/1.2254755/gatan_kring_trotthet_kan_vara_lost?lid=senasteNytt_1765014&lpos=rubrik_2254755

Virus kan ligga bakom trötthet
Sydsvenskan. 3 dec 2010.
http://www.sydsvenskan.se/sverige/article1316971/Virus-kan-ligga-bakom-trotthet.html

Virus kan ligga bakom trötthet
DN. 2 dec 2010.
http://www.dn.se/nyheter/sverige/virus-kan-ligga-bakom-trotthet-1.1220153

[Mayordomo]

Röda korset verkar nu bannlysa bloddonationer från ME-patienter.

Red Cross bars chronic fatigue patients from donating blood
The Washington Post, 2010-12-03
http://voices.washingtonpost.com/checkup/2010/12/red_cross_bars_chronic_fatique.html

American Red Cross Statement on XMRV and Chronic Fatigue Syndrome
American Red Cross, 2010-12-03
länk här

[Mayordomo]

Ett företag gör reklam för deras antiviral som säges vara effektiv emot XMRV och HIV in vitro (i provrör). De verkar även gjort fas 1 försök på människor. Antiviralen (CMX157) verkar vara en utveckling på antiviralen tenofovir.


Chimerix's Antiviral CMX157 Demonstrates Positive Phase 1 Clinical Results With Favorable Pharmacokinetics, Safety and Tolerability
http://www.prnewswire.com/news-releases/chimerixs-antiviral-cmx157-demonstrates-positive-phase-1-clinical-results-with-favorable-pharmacokinetics-safety-and-tolerability-111779284.html

[Mayordomo]

I nedanstående sammandrag av ett föredrag av Dr. Juliá Blanco (troligen från Spanien) står det att följande biomarkörer skulle kunna tänkas:
1.-Tydlig minskning av CD57 hos NK-celler (natural killer cells)
2.-Mönster av energibrist med ökad mängd CD5 av hos CD8 (T8)

Dr. Juliá presentation on XMRV and the immune system of CFS patients (first biomarkers for CFS / ME)
2010-12-13, Facebook Xand Xmrv
http://www.facebook.com/note.php?note_id=10150110833170915&id=100000436316743

Här kan man hämta upp en PDF-fil med sammanfattningen på spanska av dagsseminariet i Barcelona 2010-12-09:
http://ligasfc.org/index.php?name=News&file=article&sid=379
Direkt: http://www.ligasfc.org/index.php?name=UpDownload&req=getit&lid=161

Detta är några videos från seminariet på Youtube. Språk Spanska. Tror det är Dr Blanco Irsi Caixa som talar:
1- http://www.youtube.com/watch?v=26eIa8LZyyE
2- http://www.youtube.com/watch?v=5xoUK4dS0YI
3- http://www.youtube.com/watch?v=xFIZ3zUq36A
4- http://www.youtube.com/watch?v=RS43445DV8k
5- http://www.youtube.com/watch?v=9WK4exivsrc